大部分病毒性脑炎的感染者只有很轻微的症状 (包括头痛、易激惹或嗜睡) 或是没有任何症状，而且病情持续的时间一般也并不长。但如果病情比较严重，则可能会引起下面的一些症状：
- 困倦
- 意识错乱和丧失方向感
- 癫痫发作
- 突然发热
- 严重的头痛
- 恶心、呕吐
- 颈部强直
- 婴儿头颅上软的部位 (囟门或 “小天窗”) 膨出。
对成人来说，危急的症状一般表现为意识不清或精神错乱；对婴儿来说则主要表现为颈部强直、头颅上软的部位 (“小天窗”) 膨出；而对大一点的孩子来说可能会出现严重的头痛、突然的个性改变、意识错乱和畏光等。
