控制心率
如果房颤通过治疗后还不能恢复正常心律，那么治疗的目标就转为控制心跳速度 (即心率)。通常情况下，医生会让你服用药物地高辛，它能比较有效地控制静息时的心率，而对活动时的心率控制则不佳。因此，绝大多数患者需要额外的或其它的药物，如钙通道阻滞剂或 β 阻滞剂。一般情况下，静息时心率应该控制在 60~100 次 / 分。
有些患者不能耐受药物，或者药物治疗无效。这样的话，房室结消融治疗可作为一个选择。所谓房室结消融，就是把一根细长的导管伸入到房室结，运用射频能量破坏房室结区域组织，从而阻止心房发出的电脉冲传导至心室 (即破坏心脏本身的起搏功能)。然后再植入人工起搏器，以设定正常节律。病人在进行房室结消融手术后需要长期服用抗凝药物减少中风的风险。
预防血栓形成
绝大多数房颤患者 (包括正在治疗的患者) 发生血栓的风险很高，可能因此发生中风。如果合并其他心脏病，风险就更高。所以医生除了给予抗心律失常药物之外，还会开一些抗凝药物如华法令或者阿司匹林让患者服用。即使患者心律已经恢复正常，也可能需要终身服用抗凝药。
