肾小球肾炎的治疗和预后情况取决于疾病是急性还是慢性的、潜在的病因、症状的类型和严重程度。有些急性肾小球肾炎 (尤其是在链球菌感染后出现的)，通常能自行好转而不需要特别的治疗。
为了控制高血压并减缓肾功能的进一步受损，医生常会开下面的一些降压药物：
- 利尿剂；
- 血管紧张素转换酶抑制剂 (ACEI)；
- 血管紧张素II受体阻断剂
- 钙离子拮抗剂；
- β受体阻断剂；
医生同时可能还会对潜在的病因进行治疗，包括：
- 链球菌或其他细菌感染： 可能给予适当的抗生素治疗；
- 狼疮或血管炎： 给予糖皮质激素和免疫抑制剂；
- IgA肾病： 鱼油补充剂似乎对有些 IgA 肾病患者有帮助，医学界目前正在进一步的确认研究中。
- 古德帕斯丘综合征： 这种病有时需要用血浆置换来治疗。所谓血浆置换，就是用特制液体或捐献者身上的血浆来替代患者体内的血浆，其主要目的是去除患者体内的抗体。
对于急性肾小球肾炎和急性肾功能衰竭，短期透析有助于去除体内多余的水分并控制高血压。终末期肾病长期治疗的主要方式就是透析和肾移植。如果肾移植不可行 (经常是因为身体状况比较差)，那么透析就成为了唯一的选择。
在治疗期间，医生还会建议你改变饮食习惯，包括限制食盐的摄入量以防止或尽量减少液体潴留、水肿和高血压。限制蛋白质和钾盐的摄入以减缓代谢产物在体内的蓄积。如果你同时还患有糖尿病，维持健康的体重并控制血糖、血压水平有助于减缓肾功能的进一步减退。