医生们尚不完全清楚为什么月经期会出现不适，为什么一些女性相对于其他的更为不适，为什么不同的月份表现会不一样。有时候严重的痛经提示可能存在子宫内膜异位症（即子宫内膜组织在子宫以外的部位生长的情况）或者子宫平滑肌瘤（一种良性子宫肿瘤）。但对于大多数人来说，身体并无明显的异常。体内一种被称为前列腺素的物质似乎在痛经中起着重要的作用，但是其具体的作用方式尚未完全清楚。布洛芬和萘普生等抗炎药物能缓解疼痛和降低一些前列腺素的水平。这些药物是痛经常规治疗的主要方法。口服避孕药治疗也有一些效果。一些研究结果还发现补充鱼油、镁和维生素E可能可以帮助减轻痛经。
- 鱼油：鱼油中的ω-3脂肪酸被认为具有抗炎效果。ω-3脂肪酸通过影响前列腺素以及其他与疼痛和炎症有关的物质而缓解痛经症状。在一项历时4个月的有42位15岁-18岁的年轻女性参加的研究中，一半的参与者先每天使用6g鱼油 (含有1080mg EPA二十碳五烯酸和720mg DHA二十二碳六烯酸）2个月，然后她们转而使用安慰剂2个月。另外的一半参与者则先服用安慰剂2个月，然后换成鱼油。对照研究结果显示当这些年轻女性使用鱼油时她们的痛经症状明显减轻。另外一项双盲试验也得出了相似的结论，且发现鱼油联合维生素B12使用具有更好的效果。
- 维生素E：在一项为期5天的双盲试验中，100位痛经症状明显的年轻女性使用500单位维生素E或者安慰剂。这项治疗在预期的月经来潮前2天开始并继续使用3天。研究人员发现维生素E比安慰剂更能缓解疼痛。另外一项研究中，参与者每日两次使用维生素E 200单位，结果也发现维生素E比安慰剂更有效。目前尚不清楚维生素E如何影响痛经。
- 镁 (Magnesium)：初步的研究发现补充镁可以帮助缓解痛经。一项为时6个月由50位痛经女性参与的双盲试验发现使用镁治疗可以明显改善痛经症状。研究人员报道：经镁治疗后前列腺素F2α（一种与痛经有关的前列腺素）的水平降低。类似的结果也见于另外一项由21位女性参与的双盲试验。
- 其他有前景的自然疗法：一项小型的双盲试验发现确保摄入足量的钙 (Calcium) 和锰 (Manganese) 可以帮助控制痛经症状。另一项由43位女性参与的双盲试验发现一些证据证明针灸对于控制痛经可能也有效。类似地，发表在2008年的一项对总共有3475位女性参与的39个随机对照试验的综合分析发现：中药在治疗痛经方面有一定的效果。通过一项小型的双盲试验，研究人员发现使用磁治疗（将磁疗器作用于盆腔）可能也可以改善痛经症状。
