下述预防措施能够减少感染手足口病的几率：
- 勤洗手并要彻底洗净： 特别是在便后或更换尿布后，以及在备食前和进食前。
- 公共区域消毒： 首先使用肥皂和水，然后使用含氯漂白液。幼儿园应该严格按照时间表对公共区域进行清洁和消毒，包括公共用品如玩具，因为这些病毒能在这些物品上存活好多天。
- 教授好的卫生习惯： 身体力行给孩子做好榜样，教会他们如何养成好的卫生习惯以及如何保持干净整洁。向他们解释为什么不能把手和其它物品放入嘴中。
- 隔离被感染的患者： 因为手足口病具有极高的传染性，不要让患手足口病的孩子再去幼儿园或学校，直到退烧和口腔溃疡痊愈为止。如果你也感染了这种疾病，那么呆在家中不要去上班。患有严重 EV71 并发症 (如脑膜炎、脑炎、麻痹症、肺水肿和出血) 的孩子应该被隔离，直到他们的排泄物中不再含有此病毒。
