在正常情况下，你的卵巢每个月都会长出囊样的组织，称为滤泡。它会产生雌激素和孕激素，并释放卵子。
有时，其中的某些滤泡会继续生长。当这种情况发生时，它们被称为功能性囊肿，这是因为它们刚开始产生时是有功能的。功能性囊肿有两种类型：
- 滤泡囊肿： 大概在你月经周期的中点，你的大脑垂体腺会大量分泌一种叫做促黄体生成素 (LH) 的激素，它的功能是发出让滤泡排卵的信号。若一切都正常进行，滤泡在接到排卵信号后会破裂，排出卵子。当卵子进入输卵管后若能遇见精子，则发生受精。若 LH 激素无法正常分泌，滤泡就会发展为滤泡囊肿，即滤泡既不会发生破裂，也不会排出卵子，而是继续生长，成为囊肿 (见下图球状物，上线所示为卵巢)。滤泡囊肿一般是无害的，只有很少数会引起疼痛，并一般在2到3个月经周期内自己消失。
- 黄体囊肿： 在正常情况下，当体内的 LH 激素水平上升后，滤泡会发生破裂并排出卵子，同时还开始产生大量的雌激素和孕激素，为受孕做准备。这时的滤泡称作黄体。但有时，滤泡的卵子排出口会出现堵塞，引起液体在滤泡中集聚，即导致黄体增大，成为囊肿 (见下图中的下线所示，上线所示为卵巢)。尽管这种囊肿一般会在几周内自己消失，但有时它可能会长到直径几乎达 10 厘米那么大，并有可能引起内部出血或卵巢扭转，导致血液供应受阻，以及盆腔或腹部的疼痛。另外，如果囊肿内部充满了血液，它可能会破裂，引起内出血和突然的、尖锐的疼痛。一种用于促进排卵的生育药物 “枸橼酸氯米芬”，会增加排卵后发生黄体囊肿的风险。所幸的是，黄体囊肿不会影响或威胁已经发生的怀孕。
