单纯疱疹病毒会引起口腔和外生殖器周围产生疼痛性的水泡样病灶。不管在哪个部位，疱疹病毒均可能会潜藏于神经节，在其中病毒可以维持在不活动状态达数月或数年。这些病毒在一些因素的诱发下会复活，跑出神经节并引起疱疹 (Herpes)。常见的诱发因素有精神压力、牙科治疗、感染以及创伤等。发作的严重程度通常会随着时间的推移而逐渐减轻。常规的治疗是使用抗病毒药物，如阿昔洛韦。这些药物能降低疱疹发作的强度和持续时间。如果定期低剂量使用，能够降低发作频率。另外，这些药物还能减少疱疹的传播。
下述的自然疗法也显示出了治疗疱疹的前景：
- 香蜂叶 (Lemon balm)：它在欧洲被广泛应用于治疗生殖器和口腔疱疹。一项有66位刚发生口腔疱疹的患者参与的双盲试验显示：使用香蜂叶乳膏治疗的第二天即产生了明显的效果，不适症状减轻，水泡的数目减少，病灶变小。另外一项有116位口腔或生殖器疱疹患者参与的双盲试验显示：参与者使用10天香蜂叶乳膏后，病情获得了明显的缓解。
- 芦荟 (Aloe vera)：芦荟这种肉质植物在治疗烧伤和轻创伤方面比较有名。一些研究发现芦荟在治疗疱疹病毒感染方面也具有潜在的价值。一项由60位处于生殖器疱疹活跃期的男性参与的双盲试验发现：使用芦荟膏（0.5% 每日3次，共使用5天）能降低病灶愈合所需要的时间，和增加2周后完全痊愈的人所占的比例。
- L-赖氨酸 (L-lysine)：L-赖氨酸这种氨基酸是另外一种有名的预防疱疹的方法。定期服用足量（>1g每天）赖氨酸可以降低疱疹发作的次数和强度。不过，这种赖氨酸似乎仅对预防疱疹有用，而对于治疗疱疹却是无效的。
- 锌 (Zinc)：锌锭剂或鼻腔喷雾剂被认为可以抵御感冒病毒。最近的一项研究发现局部使用锌也许还有助于抵御口腔和面部的疱疹病毒感染。在这项试验中，46位患有疱疹感染的人每2小时涂摸一次氧化锌乳剂或安慰剂。结果显示使用氧化锌乳剂能明显降低症状的严重性和缩短恢复时间。
