医生一般在体格检查和实验室检查的基础上诊断咽喉疼痛的病因。在检查中，医生会查找链球菌性喉炎的症状，例如是否有发热和淋巴结肿大，并且很可能还查看你的咽喉，检查扁桃体是否红肿、有白色条纹或脓点，以及口腔后面上端的软腭和硬腭上是否有微小的红点。尽管这些体征表明存在感染，但是无法仅仅通过这些来明确是病毒感染还是细菌感染。事实上，有些病毒性的咽喉感染看上去比链球菌引起的感染还要严重。因此，医生一般还会进行以下的一项或多项试验来明确细菌感染：
- 咽拭子培养： 在这项检查中，医生用一个无菌的拭子在你的咽喉后部和扁桃体上擦拭一下，以获得分泌物的样本。接着将这个标本在实验室进行培养，检查是否有细菌存在。这项检查的一个缺点是，检查结果可能需要两天时间才能知道。
- 快速抗原检测： 因为等待咽拭子培养的时间较长，医生可能还会对拭子标本进行快速的抗原检测，它可以在几分钟内检测出。如果你或你的孩子链球菌检测是阳性，就可以立即进行抗生素治疗。但是快速链球菌检测有一个缺点，即对有一些链球菌咽喉感染，它查不出来。因为这个原因，许多医生还是会使用咽拭子培养，特别是如果快速检测结果是阴性时。
- 快速 DNA 检测： 一种更新的快速诊断方法是使用DNA技术对咽拭子样本进行检测，它能在1天或更短的时间内就可明确是否是链球菌性咽炎。这项检查的敏感性和咽拭子培养一样，但是结果可以更快得到。