由于生殖器疣通常难以通过肉眼观察，医生这时需事先在生殖器部位涂上醋酸溶液，使疣变白，然后通过一种特殊的显微镜 (阴道镜) 来观察。
对女性来说，定期的妇科检查和子宫颈抹片检查 (Pap tests) 是非常重要的。子宫颈抹片检查有助于发现生殖器疣导致的阴道、宫颈改变和宫颈癌的早期征象 (宫颈癌是 HPV 感染的一种可能并发症)。医学专家建议首次子宫颈抹片检查应在初次性生活后三年内或21岁 (选其中较早的那个时间)。对年龄大于30岁且连续3次检查正常的女性，可以减少检查的频率。如果已经患了生殖器疣，则需要每3-6个月行一次子宫颈抹片检查，具体间隔时间取决于病变的严重性。
