肾脏本身具有一定的抗感染能力，也就是说，它能抑制细菌的生长。然而，某些因素会增加细菌感染的机会。
- 女性独特的生理结构： 女性要比男性更容易发生肾炎，是因为女性的尿道要比男性的短得多，因而细菌从体外进入膀胱的距离就缩短。同时，女性的尿道口与阴道口和肛门非常接近，这也增加了细菌进入膀胱的机会。一旦膀胱里有细菌生长，就很容易扩散至肾脏。
- 尿路梗阻： 任何能引起尿流不畅和小便时膀胱排空困难的因素 (如肾结石、泌尿道畸形、男性前列腺肥大等) 都会增加肾盂肾炎的危险性。
- 免疫功能减弱： 某些疾病如癌症、糖尿病、艾滋病等会破坏人体的免疫系统，从而增加肾炎的危险性。某些药物 (例如用于器官移植后抑制排异反应的药物) 也会增加肾脏感染的危险性。
- 长期留置导尿管： 导尿管用于引流膀胱内的尿液，通常是在术中及术后或者诊断检查时留置。但长期留置会增加肾盂肾炎的危险性。
- 膀胱输尿管返流： 是指少部分尿液从膀胱逆流至肾脏。存在膀胱输尿管返流的人，不管是成人还是儿童，发生肾盂肾炎的危险性要高得多。
