任何会引起消化困难的疾病都有可能增加罹患胃食管反流病的风险，包括：
- 肥胖： 过多的体重会对胃及横隔 (分隔胸腹腔的肌性结构) 施加更多的压力，迫使下食管括约肌开放，导致胃酸反流入食管。饱食或进食高脂食物后也可引起类似的后果。
- 食道裂孔疝： 食道裂孔疝又称为膈疝。患有此病时，一部分胃体组织可能会疝入胸腔下端。如果疝入的组织较多，则会影响下食管括约肌，导致烧心症状加重。
- 妊娠： 妊娠可致腹压增高 (此时胃壁的压力也升高)，同时可产生较多的黄体酮激素。黄体酮可舒张体内许多的肌肉，其中包括下食管括约肌。
- 哮喘： 医学界目前尚不明确哮喘与烧心之间的具体关系。有可能是哮喘的咳嗽和呼气困难引发胸腹腔间的压力改变，触发胃酸反流入食管。一些扩张气道的平喘药物也可能造成下食管括约肌舒张，引起反酸。另外，反酸也有可能加重哮喘症状。例如在反酸时，病人可能会吸入少量的反流上来的消化液，进而损伤气道。
- 糖尿病： 胃轻瘫是糖尿病的并发症之一，它会引起胃部排空时间延长。如果食物积存在胃内的时间过长，胃内容物可反流入食管，引起烧心。
- 消化性溃疡： 幽门瓣是控制食物经胃流入小肠的重要结构。如果在其附近发生开放性溃疡或疤痕，可能会导致该活瓣功能异常，甚至阻断食物进入小肠，从而影响胃的正常排空，引起胃酸聚积而反流入食管。
- 胃排空延迟： 除了糖尿病和溃疡外，神经或肌肉功能异常也会引起胃排空延迟，导致胃酸反流入食管。
- 结缔组织病： 结缔组织病 (如硬皮病) 可引起肌肉组织肿胀增厚，干扰消化道肌肉正常的收缩和舒张，导致胃酸反流。
- 卓-艾综合症： 此病较少见，它的一个并发症就是会产生过多的胃酸，从而增加反酸的几率。
