大部分的毛细支气管炎可以在家里通过自我护理的方法进行治疗。由于毛细支气管炎是由病毒感染引起的，所以用来治疗细菌感染的抗生素起不到作用，除非是患儿同时还有细菌感染 (比如说细菌性肺炎)，那么医生可能会使用抗生素治疗。
病情严重时，医生可能会使用支气管扩张药物进行治疗，这类药物包括沙丁胺醇或吸入式的沙丁胺醇 (比如舒喘宁、喘乐宁)。它们有助于舒张肺内的气道以帮助呼吸。吸入性的抗病毒药物 (比如利巴韦林) 可能对病情也会有所帮助，但其疗效不一定很好。
如果患儿出现了毛细支气管炎的并发症，那么可能需要住院治疗。住院期间，患儿很可能会接受湿化的氧气吸入治疗，这有助于保证血液中有充足的氧气。另外，患儿还可能接受静脉输液治疗，以防止出现脱水。
目前还没有针对毛细支气管炎的预防疫苗。但是对易患严重毛细支气管炎的患儿，注射呼吸道合胞病毒单抗 (Synagis) 可以减少感染该病毒的风险，或者在感染上后有助于控制病情以致于不会发展到非常严重的阶段。这种呼吸道合胞病毒单抗只需要在该病毒感染的高发期内 (即从11月份至第二年3月份)，每月在体积较大的肌肉内 (比如大腿上) 注射一次。因为该药物价格比较昂贵，因此往往只有那些易患严重毛细支气管炎的小孩 (主要是早产儿、有心肺疾病、或免疫系统受到抑制的患儿) 才考虑使用。