梅尼埃病的病因还不是很清楚，可能与内耳液体的容量或成分出现异常有关。但至于是什么因素引起内耳液体的改变，还不得而知。
内耳由一群相互连通的管道和空洞构成，称为迷路 (见下图蓝色部分)。迷路中含有液体 (内淋巴)，迷路内壁上覆有一层毛发状的感受器。当内淋巴液体流动时，这些感受器会做出相应的反应，产生神经冲动，传递给大脑，产生包括听觉、运动、平衡等在内的感知觉。
内耳的每个部分各自负责不同的感知觉功能：
- 迷路中心部分的感受器 (前庭，见下图中心)：能够感知自身在任何方向的加速运动。
- 前庭一侧分出的三个半环 (半规管，见下图右侧)：能够感知自身的旋转运动，对维持平衡很重要。
- 前庭另外一侧为蜗旋状结构 (耳蜗，见下图左侧)：负责内耳的听力功能。
为了使内耳所有的感受器都正常运转，内淋巴液体需要维持一定的容量、压力以及化学组分。任何影响内淋巴液体特性的因素都可能引起梅尼埃病。
梅尼埃病通常只发生在某一个耳朵。但在比较罕见的情况下，双耳都可能会受影响。