虽然大部分的甲状腺结节是良性的，但是有时它们也会引起严重的并发症。大的结节或多结节甲状腺肿可能会影响吞咽或呼吸。如果结节或甲状腺肿产生过多的甲状腺素的话，则会造成更为严重的并发症，即甲状腺功能亢进。
除了会引起体重减轻、肌肉无力、怕热、焦虑或易激惹等症状之外，甲状腺功能亢进还可能引起以下的并发症：
- 与心脏相关的并发症： 这些包括心率增快、心房颤动 (一种影响心脏节律的疾病) 和充血性心力衰竭。后者是因心肌无力，导致无法泵出足够的血液供人体所需。
- 骨质疏松： 骨头的强度部分取决于骨头中钙和其他矿物质的含量。过量的甲状腺素会影响身体将钙吸收至骨头的能力。事实上，甲状腺功能亢进常常在你有其他症状之前就已经影响到了骨头，这对那些绝经后、本身就有骨质疏松高风险的女性来说，更是如此。
- 甲状腺危象： 即你的甲状腺功能亢进症状突然大大恶化，这可威胁到生命，需要立即进行治疗。