巴瑞特氏食道症会增加发生食管癌的风险。它可能导致严重程度不等的癌前改变 (即 “不典型增生”)。这些病变分为4个等级，分别是：无异常 (即无不典型增生)、轻微但有特异性改变 (轻度)、严重改变 (重度) 以及最终的侵袭性癌。当出现比较严重的异常增生时，癌症往往已经存在了。这些癌细胞可以从食道扩散至临近淋巴结，或是转移至身体的其他部位。如果存在严重的不典型增生，医生也将做更多的检查 (如胸腹部 CT 平扫和超声内镜等) 来寻找癌症的征象。超声内镜和内窥镜类似，但它能让医生更好地检查食管壁和周围淋巴结。医生在做超声内镜检查时有可能同时对可疑淋巴结进行活检。
