乳糜泻并无典型的症状。大部分患者可能会有间断性的腹泻、腹部疼痛以及腹胀的表现。但有些乳糜泻患者可能完全没有消化系统的症状。乳糜泻与其他一些疾病经常有一些相类似的临床表现，这些疾病包括：肠易激综合症、胃溃疡、克隆氏病、寄生虫感染、贫血、皮肤或神经系统病变等。
有的时候，乳糜泻会以某种不太明显的方式表现出来，比如：
- 情绪易被激怒或抑郁
- 贫血
- 胃部不适
- 关节疼痛
- 肌肉痛
- 皮疹
- 口腔溃疡
- 牙齿或骨骼病变 (例如骨质疏松症)
- 腿部或足部的麻刺感 (即某些神经发生病变)
另外，乳糜泻引起的吸收功能不良可表现为：
- 体重下降
- 腹泻
- 腹部痛性痉挛和胀气
- 身体比较虚弱
- 油性的带有恶臭或灰白色的大便
- 骨质疏松症
- 如果患者是小孩，会出现生长发育迟缓的现象