甲减的常规治疗是每天服用人工合成的甲状腺素，以恢复体内甲状腺素的水平，使身体能够正常运作。
在经过1~2周的治疗之后，你的病情一般会有明显的改善。该药物也能逐渐降低你的胆固醇水平，以及降低因甲减引起的体重增加。甲状腺素治疗通常是终身的。在治疗过程中，由于药物的剂量可能需要改变，因此，医生一般会每年检查一下你的促甲状腺素水平。
在治疗的初期，医生可能会更频繁的测定你的促甲状腺素水平 (尤其是在刚开始治疗2~3个月之后)，以确定合适的起初剂量。过量的促甲状腺素可导致食欲增加、失眠、心悸和颤抖等副作用。
如果你有冠状动脉疾病或甲减比较严重，医生在初始治疗时可能会让你服用低剂量的促甲状腺素，然后逐渐增加剂量。这可以让你的心脏对体内的代谢速度增加有一个适应的过程。
如果剂量合适，人工合成的甲状腺素几乎没有副作用，而且价格也不贵。在治疗过程中，不要因为身体感觉正常而漏药或停止服用药物。如果这样做，甲减的症状会逐渐复发。
可影响甲状腺素吸收的因素
某些药物、营养补充剂甚至一些食物都可能影响你吸收甲状腺素的能力，其中包括：
- 大量的豆制品 (少量的话没问题)
- 高纤维饮食
- 铁补充剂
- 钙补充剂
- 消胆胺 (一种降胆固醇药物)
- 氢氧化铝 (一些抗酸药物含有这种成分)
如果你需要经常或大量摄入以上的成分，最好与医生讨论一下。
非常规治疗
虽然绝大多数医生建议使用人工合成的甲状腺素来治疗甲减，但服用从猪的甲状腺提取的天然甲状腺素也可作为一种治疗方法。不过，如果你采用这种非常规的治疗方法，最好要小心一点，因为它的生产监管和质量可能无法保证。