对大部分人来说，治疗非溃疡性胃痛的重点在于预防复发和进行自我护理。但如果你经常性的出现这种疾病的话，你可能需要医学治疗。治疗的方法包括：
药物治疗
有几类药物可以用于治疗非溃疡性胃痛的症状。这些药物包括：
- 抗酸药：抗酸药是治疗消化不良的常用药物。它可以中和胃酸，快速地缓解疼痛。
- 胃酸阻滞剂：例如西咪替丁、雷尼替丁、尼扎替丁和法莫替丁等，它们可以抑制胃酸的产生。
- 质子泵抑制剂：这类药物通过抑制质子泵分子来阻止胃酸的作用。它们包括奥美拉唑、兰索拉唑、雷贝拉唑和艾美拉唑。还有一种类似的药物叫做泮托拉唑，它既可以口服，也可以静脉注射。
- 促胃动力药物：这些药物可帮助你加快胃的排空，还可以使食管与胃之间的瓣膜更加紧固，以减少上腹部的不适。胃复安是其中的一种常用的促胃动力药物，不过这种药物有不少副作用。
- 抗痉挛药物：这类药物可以放松你的小肠平滑肌，减少消化不良。常用的药物包括双环胺和莨菪碱。
- 酸抑制剂 (细胞保护剂)：这类药物包括硫糖铝和胶体次枸橼酸铋，它们有助于保护你的胃和肠道内壁的细胞组织。如果你需要经常服用 (具有刺激性的) 非甾体类抗炎药的话，医生可能会建议你同时也服用酸抑制剂，以保护你的胃。
- 低剂量的抗抑郁药：三轮列类的抗抑郁药和选择性5-羟色胺再吸收抑制剂 (SSRIs)，如果低剂量服用的话，可能帮助抑制那些控制肠道疼痛的神经元活动。医生可能会建议服用的三轮列类药物包括米帕明和阿米替林，SSRIs 类药物包括氟西汀或帕罗西汀。
- 治疗幽门螺旋杆菌感染的抗生素：如果检查结果显示你的胃中有一些会引起溃疡的幽门螺旋杆菌，即便你还没有出现溃疡，医生可能也会建议你服用抗生素治疗，有时还联合服用质子泵抑制剂。最常用的抗生素包括阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑和四环素。不过，使用抗生素来治疗还没有导致溃疡的幽门螺旋杆菌感染，对缓解病情是否真的有帮助，目前还不是非常清楚。
行为治疗
这种治疗主要侧重于改变不良的、不健康的生活习惯。例如，如果你经常暴饮暴食或吃得太快，医生可能会建议你改变这些习惯，以减少发生腹部不适的风险。